MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-1

Total Repeats: 1691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011419	GAA	2	6	57	62	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921953
2	NC_011419	CCA	2	6	206	211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921953
3	NC_011419	GC	3	6	247	252	0 %	0 %	50 %	50 %	209921953
4	NC_011419	ATC	2	6	287	292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921953
5	NC_011419	TGCGTA	2	12	332	343	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209921953
6	NC_011419	TCG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921953
7	NC_011419	CCGG	2	8	402	409	0 %	0 %	50 %	50 %	209921953
8	NC_011419	CCT	2	6	420	425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209921953
9	NC_011419	AC	4	8	469	476	50 %	0 %	0 %	50 %	209921953
10	NC_011419	GAAA	2	8	504	511	75 %	0 %	25 %	0 %	209921953
11	NC_011419	CTG	2	6	580	585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921953
12	NC_011419	GT	3	6	614	619	0 %	50 %	50 %	0 %	209921953
13	NC_011419	GAA	2	6	622	627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921953
14	NC_011419	CAG	3	9	730	738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921953
15	NC_011419	GTGAAA	2	12	749	760	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	209921953
16	NC_011419	CAG	2	6	766	771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921953
17	NC_011419	GCAGC	2	10	843	852	20 %	0 %	40 %	40 %	209921953
18	NC_011419	CGT	2	6	871	876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921953
19	NC_011419	GC	3	6	897	902	0 %	0 %	50 %	50 %	209921953
20	NC_011419	GAA	2	6	912	917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921953
21	NC_011419	CTGC	2	8	919	926	0 %	25 %	25 %	50 %	209921953
22	NC_011419	CAG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921953
23	NC_011419	GCC	2	6	972	977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921953
24	NC_011419	GCTG	2	8	1053	1060	0 %	25 %	50 %	25 %	209921953
25	NC_011419	CAA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921954
26	NC_011419	GCC	2	6	2068	2073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921954
27	NC_011419	AGG	3	9	2132	2140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209921954
28	NC_011419	GCC	2	6	2346	2351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921955
29	NC_011419	GTT	2	6	2417	2422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921955
30	NC_011419	CA	3	6	2520	2525	50 %	0 %	0 %	50 %	209921955
31	NC_011419	ATAGAT	3	18	2796	2813	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209921956
32	NC_011419	GCA	2	6	2867	2872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921956
33	NC_011419	AAT	2	6	2929	2934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921956
34	NC_011419	TTA	2	6	3254	3259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921957
35	NC_011419	TA	3	6	3316	3321	50 %	50 %	0 %	0 %	209921957
36	NC_011419	ATC	3	9	3386	3394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921957
37	NC_011419	T	6	6	3402	3407	0 %	100 %	0 %	0 %	209921958
38	NC_011419	TTC	2	6	3430	3435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921958
39	NC_011419	CTG	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921958
40	NC_011419	CCCG	2	8	3533	3540	0 %	0 %	25 %	75 %	209921958
41	NC_011419	AAG	2	6	3570	3575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921958
42	NC_011419	AAG	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921958
43	NC_011419	GAAA	2	8	3676	3683	75 %	0 %	25 %	0 %	209921958
44	NC_011419	GTA	2	6	3684	3689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921958
45	NC_011419	ATA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921958
46	NC_011419	A	7	7	3796	3802	100 %	0 %	0 %	0 %	209921958
47	NC_011419	TA	3	6	3803	3808	50 %	50 %	0 %	0 %	209921958
48	NC_011419	TCT	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921958
49	NC_011419	CA	3	6	3878	3883	50 %	0 %	0 %	50 %	209921958
50	NC_011419	TGT	2	6	3962	3967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921959
51	NC_011419	CGG	2	6	4112	4117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921959
52	NC_011419	CCA	2	6	4232	4237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921959
53	NC_011419	T	6	6	4272	4277	0 %	100 %	0 %	0 %	209921959
54	NC_011419	ATA	2	6	4408	4413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921960
55	NC_011419	GGCCT	2	10	4423	4432	0 %	20 %	40 %	40 %	209921960
56	NC_011419	TGG	2	6	4467	4472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921960
57	NC_011419	GTT	2	6	4552	4557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921960
58	NC_011419	GAGCA	2	10	4612	4621	40 %	0 %	40 %	20 %	209921960
59	NC_011419	GC	3	6	4623	4628	0 %	0 %	50 %	50 %	209921960
60	NC_011419	GGCG	2	8	4636	4643	0 %	0 %	75 %	25 %	209921960
61	NC_011419	TGA	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921960
62	NC_011419	CTT	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921960
63	NC_011419	GTT	2	6	4687	4692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921960
64	NC_011419	ACG	2	6	4732	4737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921960
65	NC_011419	GGA	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209921960
66	NC_011419	GA	3	6	4742	4747	50 %	0 %	50 %	0 %	209921960
67	NC_011419	CAGC	2	8	4953	4960	25 %	0 %	25 %	50 %	209921960
68	NC_011419	ATG	2	6	5021	5026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921960
69	NC_011419	CCATCA	2	12	5146	5157	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	209921961
70	NC_011419	GCA	2	6	5180	5185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921961
71	NC_011419	CGT	2	6	5215	5220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921961
72	NC_011419	TCA	2	6	5254	5259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921961
73	NC_011419	TTC	2	6	6516	6521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921962
74	NC_011419	TCGT	2	8	6534	6541	0 %	50 %	25 %	25 %	209921962
75	NC_011419	T	6	6	6553	6558	0 %	100 %	0 %	0 %	209921962
76	NC_011419	CCG	2	6	6564	6569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921962
77	NC_011419	ATG	2	6	6570	6575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921962
78	NC_011419	CTCG	2	8	6586	6593	0 %	25 %	25 %	50 %	209921962
79	NC_011419	GC	3	6	6644	6649	0 %	0 %	50 %	50 %	209921962
80	NC_011419	GGT	2	6	6668	6673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921962
81	NC_011419	CTC	2	6	6692	6697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209921962
82	NC_011419	TGC	2	6	6717	6722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921962
83	NC_011419	GAAGC	2	10	6806	6815	40 %	0 %	40 %	20 %	209921962
84	NC_011419	GCG	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921962
85	NC_011419	CG	3	6	6870	6875	0 %	0 %	50 %	50 %	209921962
86	NC_011419	TGCA	2	8	6910	6917	25 %	25 %	25 %	25 %	209921962
87	NC_011419	GAAC	2	8	6929	6936	50 %	0 %	25 %	25 %	209921962
88	NC_011419	GTC	3	9	6941	6949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921962
89	NC_011419	ACGC	2	8	7012	7019	25 %	0 %	25 %	50 %	209921962
90	NC_011419	GCTG	2	8	7044	7051	0 %	25 %	50 %	25 %	209921962
91	NC_011419	CGT	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921962
92	NC_011419	CGT	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921962
93	NC_011419	TGC	2	6	7394	7399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921963
94	NC_011419	GCC	3	9	7466	7474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921963
95	NC_011419	TCGCT	2	10	7484	7493	0 %	40 %	20 %	40 %	209921963
96	NC_011419	TGG	2	6	7685	7690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921963
97	NC_011419	TGCA	2	8	7730	7737	25 %	25 %	25 %	25 %	209921963
98	NC_011419	GCG	3	9	7747	7755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921963
99	NC_011419	CTA	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921963
100	NC_011419	GCT	2	6	7784	7789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921963
101	NC_011419	TCG	2	6	7886	7891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921963
102	NC_011419	TCT	2	6	7907	7912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921963
103	NC_011419	CGA	2	6	7988	7993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921963
104	NC_011419	CCA	2	6	8063	8068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921963
105	NC_011419	GGC	2	6	8106	8111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921963
106	NC_011419	CGCGA	2	10	8142	8151	20 %	0 %	40 %	40 %	209921963
107	NC_011419	TTC	2	6	8177	8182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921963
108	NC_011419	CGG	2	6	8190	8195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921963
109	NC_011419	CAGG	2	8	8229	8236	25 %	0 %	50 %	25 %	209921963
110	NC_011419	GAC	2	6	8242	8247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921963
111	NC_011419	TCGC	2	8	8269	8276	0 %	25 %	25 %	50 %	209921963
112	NC_011419	GCC	2	6	8332	8337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921963
113	NC_011419	GCC	2	6	8377	8382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921963
114	NC_011419	CAAT	2	8	8498	8505	50 %	25 %	0 %	25 %	209921964
115	NC_011419	AACC	2	8	8531	8538	50 %	0 %	0 %	50 %	209921964
116	NC_011419	CAG	2	6	8573	8578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921964
117	NC_011419	GAAT	2	8	8690	8697	50 %	25 %	25 %	0 %	209921965
118	NC_011419	CTG	3	9	8726	8734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921965
119	NC_011419	CAA	2	6	8755	8760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921965
120	NC_011419	TGC	2	6	8820	8825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921965
121	NC_011419	AG	3	6	8842	8847	50 %	0 %	50 %	0 %	209921965
122	NC_011419	AACC	2	8	8851	8858	50 %	0 %	0 %	50 %	209921965
123	NC_011419	ACA	2	6	8924	8929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921966
124	NC_011419	CTG	2	6	9018	9023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921966
125	NC_011419	TGC	2	6	9076	9081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921966
126	NC_011419	GCC	2	6	9155	9160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921966
127	NC_011419	CCATCA	2	12	9428	9439	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	209921967
128	NC_011419	GCA	2	6	9462	9467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921967
129	NC_011419	ATA	2	6	9582	9587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921968
130	NC_011419	GGCCT	2	10	9597	9606	0 %	20 %	40 %	40 %	209921968
131	NC_011419	TGG	2	6	9641	9646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921968
132	NC_011419	GTT	2	6	9726	9731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921968
133	NC_011419	GAGCA	2	10	9786	9795	40 %	0 %	40 %	20 %	209921968
134	NC_011419	GC	3	6	9797	9802	0 %	0 %	50 %	50 %	209921968
135	NC_011419	GGCG	2	8	9810	9817	0 %	0 %	75 %	25 %	209921968
136	NC_011419	TGA	2	6	9830	9835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921968
137	NC_011419	CTT	2	6	9852	9857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921968
138	NC_011419	GTT	2	6	9861	9866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921968
139	NC_011419	ACG	2	6	9906	9911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921968
140	NC_011419	GGA	2	6	9912	9917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209921968
141	NC_011419	GA	3	6	9916	9921	50 %	0 %	50 %	0 %	209921968
142	NC_011419	CAGC	2	8	10127	10134	25 %	0 %	25 %	50 %	209921968
143	NC_011419	ATG	2	6	10195	10200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921968
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145	NC_011419	GGGA	2	8	10313	10320	25 %	0 %	75 %	0 %	209921969
146	NC_011419	TCTTT	2	10	10335	10344	0 %	80 %	0 %	20 %	209921969
147	NC_011419	TTC	3	9	10345	10353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921969
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149	NC_011419	CGG	2	6	10403	10408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921969
150	NC_011419	ATA	2	6	10447	10452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921969
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152	NC_011419	GGT	2	6	10474	10479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921969
153	NC_011419	ACG	2	6	10488	10493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921969
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155	NC_011419	CAC	2	6	10500	10505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921969
156	NC_011419	TTC	2	6	10524	10529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921969
157	NC_011419	T	6	6	10534	10539	0 %	100 %	0 %	0 %	209921969
158	NC_011419	AGA	2	6	10917	10922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921970
159	NC_011419	TAC	2	6	11013	11018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921970
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162	NC_011419	ACC	2	6	11278	11283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921970
163	NC_011419	TGA	2	6	11284	11289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921970
164	NC_011419	CTC	2	6	11344	11349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209921970
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167	NC_011419	GCA	2	6	11653	11658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921970
168	NC_011419	TCA	2	6	11709	11714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921970
169	NC_011419	ATC	2	6	11813	11818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921970
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173	NC_011419	ATC	2	6	12189	12194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921970
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250	NC_011419	ATCC	2	8	16103	16110	25 %	25 %	0 %	50 %	209921975
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252	NC_011419	TATCA	2	10	16256	16265	40 %	40 %	0 %	20 %	209921976
253	NC_011419	GA	3	6	16534	16539	50 %	0 %	50 %	0 %	209921977
254	NC_011419	GC	3	6	16540	16545	0 %	0 %	50 %	50 %	209921977
255	NC_011419	ATC	2	6	16727	16732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921977
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260	NC_011419	GA	3	6	17046	17051	50 %	0 %	50 %	0 %	209921978
261	NC_011419	CAC	2	6	17088	17093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921978
262	NC_011419	CTG	2	6	17123	17128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921978
263	NC_011419	ATA	2	6	17129	17134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921978
264	NC_011419	GCA	2	6	17358	17363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921978
265	NC_011419	A	9	9	17413	17421	100 %	0 %	0 %	0 %	209921978
266	NC_011419	CG	3	6	17966	17971	0 %	0 %	50 %	50 %	209921979
267	NC_011419	GCT	2	6	17988	17993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921979
268	NC_011419	ATTT	2	8	18044	18051	25 %	75 %	0 %	0 %	209921979
269	NC_011419	CTT	2	6	18105	18110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921979
270	NC_011419	G	6	6	18159	18164	0 %	0 %	100 %	0 %	209921979
271	NC_011419	CGTTA	2	10	18278	18287	20 %	40 %	20 %	20 %	209921979
272	NC_011419	A	7	7	18319	18325	100 %	0 %	0 %	0 %	209921979
273	NC_011419	GC	4	8	18341	18348	0 %	0 %	50 %	50 %	209921979
274	NC_011419	ACT	2	6	18368	18373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921979
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279	NC_011419	CTG	2	6	18511	18516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921979
280	NC_011419	TTA	2	6	18631	18636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921979
281	NC_011419	TGA	2	6	18698	18703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921979
282	NC_011419	ATA	2	6	18744	18749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921979
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284	NC_011419	CAT	2	6	18866	18871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921979
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286	NC_011419	AT	3	6	18929	18934	50 %	50 %	0 %	0 %	209921979
287	NC_011419	CGG	2	6	19009	19014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921979
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292	NC_011419	TAACT	2	10	19253	19262	40 %	40 %	0 %	20 %	209921979
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294	NC_011419	A	6	6	19378	19383	100 %	0 %	0 %	0 %	209921979
295	NC_011419	ATG	2	6	19429	19434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921979
296	NC_011419	A	6	6	19503	19508	100 %	0 %	0 %	0 %	209921980
297	NC_011419	AGC	2	6	19580	19585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921980
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299	NC_011419	CA	4	8	19810	19817	50 %	0 %	0 %	50 %	209921980
300	NC_011419	GAT	2	6	19822	19827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921980
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304	NC_011419	TCAT	2	8	20189	20196	25 %	50 %	0 %	25 %	209921980
305	NC_011419	T	6	6	20255	20260	0 %	100 %	0 %	0 %	209921980
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362	NC_011419	A	7	7	25322	25328	100 %	0 %	0 %	0 %	209921986
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381	NC_011419	CAT	2	6	26233	26238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921987
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384	NC_011419	GCT	2	6	26357	26362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921987
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388	NC_011419	CGG	2	6	26543	26548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921988
389	NC_011419	CTG	2	6	26599	26604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921988
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